+++ /dev/null
----
-layout: post
-status: publish
-published: true
-title: DIY Gelelektrophorese am Open Lab Day, 08.04.2018
-author:
- display_name: salmonella
- login: salmonella
- email: elisabeth.bs@gmx.at
- url: ''
-author_login: salmonella
-author_email: elisabeth.bs@gmx.at
-wordpress_id: 1004
-wordpress_url: http://wp.realraum.at/?p=1004
-date: '2018-04-19 17:31:33 -0500'
-date_gmt: '2018-04-19 15:31:33 -0500'
-categories:
-- realraum News
-- OLGA
-- german
-tags: []
-comments: []
----
-<p>Im Sommer wurde eine Gel-Elektrophorese (unten links) vor der Verschrottung gerettet. Wieder voll funktionstüchtig trennt man damit DNA Fragmente der Größe nach auf.  Im rechten Bild sieht man die von unserem Biohacker Esef selbst gebaute DIY Gel-Elektrophorese, die am Sonntag ihren ersten Einsatz mit DNA Proben und Plasmiden hatte.</p>
-<p><a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_212131.jpg"><img class="alignnone size-medium wp-image-1008" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_212131-300x225.jpg" alt="img_20180408_212131" width="300" height="225" /></a><a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_205822.jpg"><img class="alignnone size-medium wp-image-1007" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_205822-300x225.jpg" alt="img_20180408_205822" width="300" height="225" /></a></p>
-<p>Die verwendeten DNA Proben wurden von Studierenden während den Uni Kursen hergestellt, welche im Anschluss üblicherweise entsorgt werden. Am Sonntag haben sie dann doch noch einen Nutzen gefunden.</p>
-<p>[caption id="attachment_1006" align="alignnone" width="300"]<a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_203926.jpg"><img class="size-medium wp-image-1006" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_203926-300x225.jpg" alt="Hier wird nicht gekocht, sondern das Agarose Gel in die Kammer gelegt, mit Puffer bedeckt und mit DNA Proben beladen " width="300" height="225" /></a> Hier wird nicht gekocht, sondern das Agarose Gel in die Kammer gelegt, mit<br />Puffer bedeckt und mit DNA Proben beladen[/caption]</p>
-<p>Ein kleines Agarosegel Stück wird mit einem 1kb Standard, einem bekannten Plasmid und mit einer unspezifischen DNA Probe beladen. Nach der Elektrophorese lassen sich DNA Fragmente noch nicht gleich erkennen. Um sie sichtbar zu machen färbt man die Proben mit einer fluoreszierenden Substanz (Roti®-Load DNAstain) ein und hält sie unter UV-Licht.<br />
-Im unteren Bild links ist ein 1kb Standard aufgetragen mit dem man die Größe der Plasmide, welche als dünne Banden im oberen Bereich des Bildes aufscheinen, abschätzen kann. Die dicken hellen Banden können RNA-Wolken, unspezifische, abverdaute oder abgebrochene DNA Stücke, in Form von sogenannten „Schlieren“ sein. Sehen zwar interessant aus, sind aber unbrauchbar.</p>
-<p><em>­­</em></p>
-<p>[caption id="attachment_1009" align="alignnone" width="300"]<a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_214319.jpg"><img class="size-medium wp-image-1009" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_214319-300x225.jpg" alt="1% Agarosegel auf UV-Licht" width="300" height="225" /></a> 1% Agarosegel auf UV-Licht[/caption]</p>
-<p>Im Vergleich zur Standard Gelelektrophorese bei der man UV-Licht nimmt, verwendet Esef blaues Licht. Um die fluoreszierenden DNA Banden im Gel zu erkennen, sieht man durch den orangen Filter, der sowohl Deckel, als auch als Außengehäuse der Apparatur ist.</p>
-<p>[caption id="attachment_1010" align="alignnone" width="225"]<a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_220405.jpg"><img class="size-medium wp-image-1010" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_220405-225x300.jpg" alt="Auswertung der „esefbox_v1“" width="225" height="300" /></a> Auswertung der „esefbox_v1“[/caption]</p>
-<p>Zum Schluss noch ein Bild das beweist, dass Geduld eine Tugend ist.<br />
-Anstatt nach Protokoll das Gel 16h lang mit geringer Konzentration einzufärben, probierten wir eine hoch-% Methylenblau-Lösung aus, welche das Gel viel zu intensiv färbte (zu sehen als schwarz blaues Rechteck links unten).<br />
-Experiment fehlgeschlagen, aber genau dafür ist das auch OLGA da. 😊</p>
-<p><a href="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_193330.jpg"><img class="alignnone size-medium wp-image-1005" src="http://wp.realraum.at/wp-content/uploads/2018/04/IMG_20180408_193330-225x300.jpg" alt="img_20180408_193330" width="225" height="300" /></a></p>
projects / homepage.git / blobdiff